微生物學是生物學中最早出現的分支學科之一，其研究大方向可以分為基礎微生物學和應用微生物兩類。在基礎微生物學的培養中，要求學生掌握扎實的理論功底，具備創新性思維、良好的英語閱讀能力和文獻查閱能力，同時還要有良好的寫作能力。該方向的畢業生可到科研院所、學校等單位從事研究與教學工作。而在應用微生物學的培養中，除了上述培養要求外，有些專業還要求學生掌握生物工程設備的使用原理。

微生物學是生物學里的一個大學科，就讀于不同方向的學生在就業上所處的境遇會不同。就讀于偏向于基礎理論研究的學科，在工作選擇上，一般只能選擇到大學或研究所工作，而這些單位對招聘對象的要求也很高，一般要求應聘者拿到博士學位。如果所學專業偏向于應用的領域，就業的選擇面要廣得多，可到企業、政府部門、學校從事生產、檢測和教學等工作。目前在微生物專業中，比較熱門的研究方向是生物能源和微生物制藥，尤其在制藥方面，就業率一直都比較高。

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